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3．“专用基金”科目。
新制度设置了“专用基金”科目，其核算内容与原制度相应科目有所不同。主要区别是：新制度下的“专用基金”科目的核算范围与原制度规定范围不同，原制度“专用基金”科目包括修购基金、职工福利基金、住房基金、留本基金等，新制度“专用基金”科目包括医疗风险基金、职工福利基金、奖励基金和其他专用基金。转账时，应将原账中“专用基金――职工福利基金”明细科目的余额转入新账中“专用基金――职工福利基金”明细科目，对于职工福利基金中含有职工福利费的，应将其余额分析结转入新账中的“其他应付款”科目；应将原账中“专用基金――修购基金”明细科目的余额转入新账中“事业基金”科目。按照地方有关规定需要继续提取或保留住房基金和留本基金的，应将原账中“专用基金――住房基金”、“专用基金――留本基金”明细科目的余额转入新账中“专用基金――其他专用基金”明细科目；按照地方有关规定不再继续提取或保留住房基金和留本基金的，应将原账中“专用基金――住房基金”、“专用基金――留本基金”明细科目的余额转入新账中“事业基金”明细科目。
4．“收支结余”科目。
新制度未设置“收支结余”科目，但设置了“本期结余”科目。转账时，应将原账中的“收支结余”科目的余额分析转入新账中的“本期结余”科目。
（四）收入支出类。
“财政补助收入”、“上级补助收入”、“医疗收入”、“药品收入”、“其他收入”、“医疗支出”、“药品支出”、“管理费用”、“财政专项支出”、“其他支出”科目。
由于原账中以上收入支出科目期末无余额，不需要进行转账处理。自2011年7月1日起，基层医疗卫生机构应按照新制度设置收入、支出科目并进行账务处理，并按照新制度要求设置新账中的有关限定用途资金备查簿，即将尚未支用的财政补助资金和其他限定用途资金分析登记入“财政基本支出备查簿”、“财政项目支出备查簿”和“其他限定用途资金备查簿”。
三、新旧会计报表衔接
（一）2011年7月1日的期初资产负债表的编制。
基层医疗卫生机构应根据上述规定转账并作调整后的各会计科目2011年7月1日的月初余额，按照新制度编制2011年7月1日的期初资产负债表。
（二）2011年会计报表的编制。
1. 2011年7-12月会计报表。
基层医疗卫生机构在编制2011年7-12月的月度资产负债表时，不要求填列“年初余额”栏。
基层医疗卫生机构在编制2011年7-12月的月度、季度收入支出总表、业务收支明细表和财政补助收支明细表时，应在表中“本月数”栏之前增加“1-6月”栏，该栏数据根据2011年1-6月原账中收支数据按新制度收支分类口径进行调整后的数据填列（不改变原账中收支计量口径）。表中“本月数”栏按新制度规定的填列口径填列7-12月各月份的数据。表中“本年累计数”栏按照表中“1-6月”栏数据加上7-12月按新制度口径计算的数据填列。
2. 2011年度会计报表。
基层医疗卫生机构应编制的2011年度会计报表包括资产负债表、收入支出总表、业务收支明细表、财政补助收支明细表和净资产变动表。
在编制2011年年末资产负债表和净资产变动表时，不要求填列“年初余额”栏。
在编制2011年度收入支出总表、业务收支明细表和财政补助收支明细表时，不要求填列上年比较数，但应在“本年累计数”栏之前增加“1-6月”栏，该栏数据的填列方法同上述2011年7-12月报表的编制。
（三）2012年度会计报表的编制。
基层医疗卫生机构应按照新制度规定编制2012年的月度、季度、年度会计报表。在编制2012年度收入支出总表、业务收支明细表和财政补助收支明细表时，不要求填列上年比较数。
附：基层医疗卫生机构新旧会计科目对照表
附：
基层医疗卫生机构新旧会计科目对照表
